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Cientistas têm observado que os avanços tecnológicos no sequenciamento do DNA se espelharam na lei de Moore para microprocessadores, isto é, o número de elementos funcionais que podem ser colocados em um chip por custo unitário tem dobrado a cada dezoito meses, nas últimas décadas. De fato, as novas gerações de sequenciadores de DNA estão aumentando a velocidade de leitura muito mais rapidamente que o previsto pela lei de Moore. O primeiro genoma humano sequenciado demorou três ou quatro anos para ficar pronto e custou cerca de US$ 300 milhões. Acredita-se que, em dez anos, uma sequência do genoma humano individual vai custar menos de US$ 1 mil 300 mil vezes menos do que custou a primeira , e poderá ser feita em apenas um dia. Na próxima década, avanços similares em outras tecnologias biomédicas relevantes possibilitarão o aparecimento de uma medicina previsiva e personalizada. Com relação ao sequenciamento de genoma, julgue os próximos itens.
O sequenciador 454 produz sequências de cerca de 250 bases de comprimento, enquanto o Illumina obtém fragmentos de DNA com 45 bases, no máximo.
Julgue os itens que se seguem, acerca da organização de bancos de dados de genes.
Anotação genômica é o processo de predição funcional de genes com base em comparações com bancos de dados.
Julgue os itens que se seguem, acerca da organização de bancos de dados de genes.
No banco de dados de ESTs (etiquetas de sequências expressas) armazenado no GenBank, estão estocadas sequências curtas de cerca de 200 a 500 nucleotídeos e identificadas como únicas em um genoma resultante de um amplicon pela reação da polimerase em cadeia (PCR).
Julgue os itens que se seguem, acerca da organização de bancos de dados de genes.
As bases de dados COG e KOG são bases de dados de proteínas ortólogas de organismos procariotos (COG) e eucariotos (KOG).
O microarranjo é uma técnica que busca medir os níveis de expressão de transcritos em larga escala. A tecnologia dos microarranjos tem impulsionado, de maneira importante, a pesquisa de genômica funcional de diferentes organismos, desde a bactéria até o ser humano, em situações normais e patológicas (câncer, doenças autoimunes, doenças degenerativas, entre outras). Considerando os processamentos bioinformáticos dos experimentos de microarranjo, julgue os itens a seguir.
De modo geral, os passos para a análise de microarranjos são: preparação, aquisição, processamento, análise da imagem, quantificação e normalização e, finalmente, a identificação dos genes diferencialmente expressos.
O microarranjo é uma técnica que busca medir os níveis de expressão de transcritos em larga escala. A tecnologia dos microarranjos tem impulsionado, de maneira importante, a pesquisa de genômica funcional de diferentes organismos, desde a bactéria até o ser humano, em situações normais e patológicas (câncer, doenças autoimunes, doenças degenerativas, entre outras). Considerando os processamentos bioinformáticos dos experimentos de microarranjo, julgue os itens a seguir.
As medidas de intensidade de fluorescência, em cada canal de cor da imagem, podem ser distorcidas durante os passos de preparação de dados. A normalização de dados desconsidera condições experimentais como as variações de intensidade e hibridização.
O microarranjo é uma técnica que busca medir os níveis de expressão de transcritos em larga escala. A tecnologia dos microarranjos tem impulsionado, de maneira importante, a pesquisa de genômica funcional de diferentes organismos, desde a bactéria até o ser humano, em situações normais e patológicas (câncer, doenças autoimunes, doenças degenerativas, entre outras). Considerando os processamentos bioinformáticos dos experimentos de microarranjo, julgue os itens a seguir.
A normalização utiliza descritores estatísticos que incluem a média, mediana, moda ou percentil da distribuição da intensidade das amostras no arranjo.
O microarranjo é uma técnica que busca medir os níveis de expressão de transcritos em larga escala. A tecnologia dos microarranjos tem impulsionado, de maneira importante, a pesquisa de genômica funcional de diferentes organismos, desde a bactéria até o ser humano, em situações normais e patológicas (câncer, doenças autoimunes, doenças degenerativas, entre outras). Considerando os processamentos bioinformáticos dos experimentos de microarranjo, julgue os itens a seguir.
O desenho experimental de um microarranjo permite a identificação de genes diferencialmente expressos e o desenvolvimento de novas ferramentas de diagnóstico.
O microarranjo é uma técnica que busca medir os níveis de expressão de transcritos em larga escala. A tecnologia dos microarranjos tem impulsionado, de maneira importante, a pesquisa de genômica funcional de diferentes organismos, desde a bactéria até o ser humano, em situações normais e patológicas (câncer, doenças autoimunes, doenças degenerativas, entre outras). Considerando os processamentos bioinformáticos dos experimentos de microarranjo, julgue os itens a seguir.
A técnica de microarranjo permite a detecção de centenas e milhares de alterações em genes codificadores de proteínas e anormalidades em genes não codificadores.
O microarranjo é uma técnica que busca medir os níveis de expressão de transcritos em larga escala. A tecnologia dos microarranjos tem impulsionado, de maneira importante, a pesquisa de genômica funcional de diferentes organismos, desde a bactéria até o ser humano, em situações normais e patológicas (câncer, doenças autoimunes, doenças degenerativas, entre outras). Considerando os processamentos bioinformáticos dos experimentos de microarranjo, julgue os itens a seguir.
A análise não supervisionada define classes de tumores por meio do agrupamento de genes ou espécimes, com base nas semelhanças dos perfis de expressão gênica, sem qualquer organização inicial.
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